來自土壤中常見細菌菌株的單一蛋白質(zhì)將為科學家提供一種更精確的RNA編輯方法。

康奈爾大學，洛克菲勒大學和紀念斯隆·凱特琳癌癥中心的最新研究發(fā)表在7月3日的《科學》雜志上，該蛋白質(zhì)稱為AcrVIA1，可以終止CRISPR-Cas13編輯過程。

共同作者馬丁·維德曼(Martin Wiedmann)博士說：“我們正在擴展科學工具箱，以有效使用CRISPR而不會引起副作用。”'97年，蓋勒特(Gellert)家庭食品安全教授，康奈爾大學(Cornell)食品安全實驗室和牛奶質(zhì)量改善計劃主任。“由于這種細菌，我們有機會關(guān)閉并增強對RNA進行改變的能力。”

CRISPR，或成簇的規(guī)則間隔的短回文重復序列，是一種實驗室機制，可以像顯微剪刀一樣起作用，并精確地編輯DNA中包含的基因。在當今使用的六種類型的CRISPR中，CRISPR-Cas13可以編輯RNA，迄今為止，RNA在編輯過程中缺乏制止作用。

科學家們說，由于導致COVID-19病的冠狀病毒SARS-CoV-2是一種RNA病毒，因此這種新的編輯附件可能對冠狀病毒研究人員有用。

主要作者Alex Meeske是洛克菲勒大學教授，高級作者Luciano Marraffini實驗室的博士后研究人員，他懷疑李斯特菌中的蛋白質(zhì)(噬菌體)可能對RNA編輯有用。

在研究開始之初，Meeske與食品安全專家Wiedmann取得了聯(lián)系，以從他的食物病原體收集物中獲取遺傳細菌樣本。魏德曼實驗室的博士生廖景秋將研究范圍從大約1,500個細菌候選者縮小到62個菌株。

Wiedmann實驗室將這些樣品轉(zhuǎn)移到了洛克菲勒，在那里實習生愛麗絲·卡塞爾(Alice Cassel)對62個菌株進行了測序，并分離了20種候選蛋白質(zhì)。

一種菌株脫穎而出：李斯特菌Seeligeri，一種在土壤中到處可見的無害細菌。不像它的強大表親(食源性單核細胞增生李斯特菌)，它不會引起人類疾病。

洛克菲勒大學的科學家發(fā)現(xiàn)，源自L. seeligeri的蛋白AcrVIA1立即停止了CRISPR編輯過程。Meeske說：“ AcrVIA1在控制Cas13的應用中非常有用。任何Cas13編輯的東西，這種抗CRISPR蛋白都可以關(guān)閉。”“這是您可以在CRISPR編輯過程中使用的'kill switch'，它已成為我們可使用的其他工具。”

維德曼解釋說，科學家現(xiàn)在可以用更嚴格的手段研究RNA問題。他說：“這種工具使我們更加精確。”